La titulación de Doctorado en Ciencias Aplicadas y Medioambientales tiene un importante carácter estratégico tanto en la provincia de Almería, como en la Comunidad andaluza, en el estado español, la Unión Europea y a nivel global, dado que pretende cubrir la demanda innovadora en campos básicos y con gran desarrollo futuro como son la energía solar, la agricultura intensiva, el medio ambiente y los recursos naturales. Los profesores que participan han colaborado a nivel de proyectos y contratos de investigación con distintas entidades y empresas del sector.
En la UAL se han desarrollado varios Centros de Investigación, como CIESOL (Centro de Investigaciones de la Energía Solar), BITAL (Centro de Investigación en Biotecnología Agroalimentaria) que forma parte del Campus de Excelencia Internacional Agroalimentario (Ceia3), CAESCG (Centro Andaluz para la Evaluación y Seguimiento del Cambio Global), Centro de Energías Renovables, Centro Científico Tecnológico del PITA, que demandan investigadores en un amplio rango de perfiles que quedan incluidos en una o varias líneas de investigación enmarcadas en este doctorado, como Cambio Global, Energías Renovables, Acuicultura, Dinámica del Carbono o Hidrogeología.